Ученые из Института цитологии и генетики в Новосибирске при содействии немецких коллег из университета Мартина Лютера (ФРГ) изобрели способ повышения эффективности анализа геномных экспериментов.
В пресс-релизе российского учреждения говорится, что дорогостоящие эксперименты удалось ускорить за счет улучшения программного комплекса. Был найден более быстрый алгоритм поиска в ДНК мотивов - зон, которые отвечают за взаимодействие с белками, читающими информацию.
Алгоритм может использоваться для поиска новых партнеров уже известных белков-регуляторов, ключевых для выполнения важных физиологических функций организма, например, иммунного ответа.
Ранее для поиска мотивов белка-регулятора в геноме применялся эксперимент под названием ChIP-seq, который стоил до нескольких тысяч долларов. При этом не учитывалось, что белки иногда работают не в одиночку. Новый комплекс должен успешно решить эту проблему.
