Российские и американские ученые в рамках исследования по борьбе с малярией собрали геном комара, который поможет "отучить" насекомое пить кровь человека и переносить паразитов, вызывающих болезнь. Результаты исследования опубликованы в журнале GigaScience.
В проекте, стартовавшем в 2018 году, участвуют ученые из Политехнического института Вирджинии, Университета Джорджа Вашингтона и Университета ИТМО. Собранные специалистами данные будут использованы для поиска участков генов, ответственных за передачу малярии.
"Сборка генома комара — это задача среднего уровня сложности. С одной стороны, у него достаточно большой геном: примерно 300 миллионов символов, всего в десять раз меньше, чем у человека. С другой стороны, у комаров всего три пары хромосом, а не 23, как у человека. Так как из одного комара получается мало генетического материала, мы использовали материал со всей колонии, то есть в секвенатор попадает ДНК сразу множества особей. В итоге мы видим все индивидуальные различия отдельных комаров, которые необходимо нивелировать, чтобы собрать референсный геном", — пояснил сотрудник Научно-образовательного центра геномного разнообразия ИТМО Антон Замятин, которого цитирует пресс-служба ИТМО.
Геном выделила группа исследователей из Политехнического университета Вирджинии, в распоряжении которой имеются целые колонии насекомых, затем специалисты Университета ИТМО приступили к его сборке. В дальнейшем российские ученые собираются осуществить новые проекты, связанные со сборками референсных геномов других видов малярийных комаров.
Всего к малярийным комарам относят 400 видов насекомых, но основными переносчиками считаются 30 из них. Малярию вызывает паразит Plasmodium, комары передают его человеку при укусе. Ученые в хоте исследования пытаются определить, как на генетическом уровне сформированы различия в пищевом поведении комаров-носителей и их более безопасных сородичей.
